Secuenciadores automáticos

El equipo funciona de forma completamente automática inyectando las muestras (que se preparan exactamente igual que durante la secuenciacion en geles y se colocan en una placa de 96 pocillos), en un capilar previamente cargado con un cierto polimero que funciona como lo hace la matriz de acrilamida:bisacrilamida:urea de los geles de secuencia, permitiendo resolver fragmentos de ADN de cadena sencilla que se diferencian en una unica base.

A una altura determinada el laser detecta la fluorescencia emitida por cada cadena sencilla de ADN fluorescente y traduce esta emision de fluorescencia en la secuencia correspondiente. Una vez desarrollada la electroforesis de la primera muestra, el capilar se vacía rellenandose nuevamente con polímero fresco: Se inyecta a continuación una segunda muestra,se procede a desarrollar nuevamente la electroforesis y así sucesivamente. (ver diagrama)

Fotografía: ABI Prism 310

Las principales ventajas de estos nuevos equipos son:

• Automatización completa de todo el proceso, no siendo necesaria siquiera la presencia de un técnico que cargue las muestras en los diferentes capilares del equipo.
• Rapidez en el analisis de cada muestra: dado el pequeño diámetro de los capilares, se pueden aplicar voltajes mayores que en los geles de acrilamida:bisacrilamida:urea, por lo que pueden leerse del orden de 450 nucleotidos en el plazo de una hora mientras que esta misma longitud de secuencia necesita unas 2-4 horas en un secuenciador en gel.
• El tiempo necesario del proceso es. para la polimerizacion del mismo, unas dos horas y para la preelectroforesis, una hora aproximadamente.