El sistema de ficheros típico de Linux es el Ext2. Existiendo otras posibilidades. Linux es además capaz de entender el resto de tipos de sistemas de ficheros de los demás Sistemas Operativos. Es un sistema muy seguro que mantiene la privacidad de los datos y los permisos de lectura, escritura y ejecución para cada usuario y grupos de usuarios.
Veamos como es el arbol de directorios de un sistema Linux típico:
El disco en el sistema Ext2 esta organizado de una forma repetitiva parecida a esto (a nivel de arquitectura del sistema de ficheros):
